Breve curriculum vitae
Laurea conseguita: Laurea Magistrale in Biotecnologie Mediche e Farmaceutiche (LM-9) Ateneo di provenienza: Università degli Studi di Firenze
Esperienze di ricerca:
- 01/02/2012–10/10/2015: internship presso il Dipartimento di Medicina Sperimentale e Clinica dell’Università degli Studi di Firenze, sotto la supervisione del prof. Francesco Annunziato. La mia ricerca si è focalizzata sulla caratterizzazione fenotipica e funzionale delle ILC2
- 01/10/2016–10/10/2017: internship presso il Dipartimento di Scienze Biomediche, Sperimentali e Cliniche dell’Università degli Studi di Firenze, sotto la supervisione del prof. Mario Del Rosso. La mia ricerca si è focalizzata sullo studio dell’interazione tra EGFR ed uPAR nell’acquisizione della resistenza al vemurafenib di cellule di melanoma.
- 15/10/2017-in corso: PhD fellowship presso il Dipartimento di Medicina Sperimentale e Clinica dell’Università degli Studi di Firenze, sotto la supervisione del prof. Alberto Magi. La mia ricerca si focalizza sullo sviluppo di metodi computazionali per l’identificazione di espanzioni di sequenze ripetute nel DNA derivato dal sequenziamento con sequenziatori di terza generazione.
Esperienza estera: Visitor bioinformatician ad EMBL (European Molecular Biology Laboratory)- EBI (European Bioinformatic Institute), GeneCore (head: Vladimir Benes), sotto la supervisione scientifica di Tobias Rausch.
Pubblicazioni e abstracts
Pubblicazioni:
1.NanoR: A user-friendly R package to analyze and compare nanopore sequencing data. Bolognini D, Bartalucci N, Mingrino A, Vannucchi AM, Magi A. PLoS One. 2019 May 9;14(5):e0216471.
2.Versatile Quality Control Methods for Nanopore Sequencing. Bolognini D, Semeraro R, Magi A. Evolutionary Bioinformatics. 2019 July 23;15:1176934319863068
3.Nano-GLADIATOR: real-time detection of copy number alterations from nanopore sequencing data. Magi A, Bolognini D, Bartalucci N, Mingrino A, Semeraro R, Giovannini L ,Bonifacio S, Parrini D, Pelo E, Mannelli F, Guglielmelli P ,Vannucchi AM. Bioinformatics. 2019 Apr 5. pii: btz241.
4 (Abstract). Large Genomic Alterations Occurring in the Transition from Chronic to Blast Phase of Chronic Myeloproliferative Neoplasms. Niccolò Bartalucci, Alberto Magi, Elisa Contini, Davide Bolognini, Simone Romagnoli, Paola
